黏液物质染色有多种方法，如AB-PAS染色、黏液HID-AB染色、标准阿利新蓝染色等。以上方法大多是利用阿利新蓝(Alcian)属于阳离子染料可与酸性基团结合，也即阿尔辛蓝与组织内含有的阴离子基团如羧基和硫酸根形成不溶性复合物这一原理。然而以上的方法不是专门显示中性黏液物质的。黏液卡红染色主要用于显示中性黏液物质，也可显示酸性粘液物质和新型隐球菌。特别适用于显示胃和上皮的黏液，临床上多用于分泌黏液的上皮癌的鉴别。

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