联系人:郑立颖
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地址:北京市海淀区上地三街9号嘉华大厦D座1101室
Definiens Tissue Studio提供了无与伦比的组织形态与生物标志物表达定量分析解决方案,是生物标记物与形态学特征研究的最佳选择
Definiens Tissue Studio提供局部单个细胞的生物标记物分析,同时也可对细胞和亚细胞结构进行相关的、多参数形态学定量分析。无论您使用的是明视场图像还是免疫荧光图像,是整体组织切片还是组织芯片,Definiens Tissue StudioTM 是您进行综合数字病理图像分析的最优手段。
描述:图片1Definiens Tissue Studio全面支持免疫荧光图像的定量分析。在本案例中,被DAPI,CD206,CD68以及一种候选治疗抗体标记的异种移植组织中,细胞核被全部探测出来。最多可支持12个通道。
Definiens Tissue Studio支持大多数的商业图像格式
Definiens Tissue Studio支持市场上最常见的数字成像系统所生成的原始图像格式。这一特性使科研人员能够标准化图像分析平台,从而改善生产率和再生性。Definiens Tissue Studio同时也支持.tiff,.jpeg,.bmp以及.jpeg2000图像格式。
一个简单的操作平台,同时适用于明视场与免疫荧光图像分析
只需简单的运行程序,选择你需要分析明视场或是免疫荧光图像,并选择切片或是组织芯片格式。无需任何附加软件。
Definiens Tissue StudioTM 提供操作简便的四步工作流程
载入、设置、运行、查阅,就是这么简单。初次使用的用户只需大约20分钟即可开发出个性化的图像分析解决方案。只需简单的“载入”图像数据,从一系列内置图像分析模块中选择并“设置”适当的解决方案,之后即可通过并行批处理的方式将其自动化“运行”于整个图像数据,并“查阅”分析结果。输出结果被保存在易于查找的文件夹中,并包含了所探测到结构的目视检查结果以及单一对象、分类后图像的统计学信息乃至更多。
描述:分析构建器简单的通过颜色来区分不同的设置面板,从而使开发个性化图像分析方案变得非常简单。
使用Definiens ComposerTM技术探测感兴趣的区域—交互、简单、精确、可靠
Definiens ComposerTM技术是一种非常易于操作的方法,它可以被用来执行稳健的感兴趣区域的探测。在“实例学习(learn by example)”格式下,你只需要简单的使用画笔在相应的感兴趣区域涂上颜色,然后点击“学习(Learn)”按钮,系统就可以准确的识别所要探测的区域,整个过程操作简单。Definiens Tissue StudioTM 可以调整Definiens ComposerTM技术,从而应用于更为精确的感兴趣区域探测。
Definiens ComposerTM技术控制面板。在Definiens Tissue StudioTM 中最新添加了“选择特征(select feature)”按钮,可以用来调整Definiens ComposerTM技术的性能表现。
运行Definiens ComposerTM技术—在这幅图当中,所有被Her2染色的乳腺肿瘤组织被分类为橙色对象;周围组织为黄色;白色区域组织为蓝色。
在需要手动注释时,Magnetic Snap工具可以帮助用户描绘感兴趣区域的轮廓,从而使手动注释更为快速和简单。Magnetic Snap工具可以与Definiens ComposerTM技术相结合使用。
描述:使用Magnetic Snap工具
Definiens Tissue StudioTM 可以精确的探测并分析细胞级组件
在细胞级分析当中,Definiens Tissue StudioTM 可以实现对细胞核、细胞核形态、细胞(细胞质或细胞膜标记物)、标记区域以及血管组织进行分析。
在通过Definiens ComposerTM技术对软件进行感兴趣区域识别训练后,还可以选择子集合(例如从肿瘤区域)来设置系统,以便正确的识别细胞和亚细胞物质(细胞膜、细胞质、细胞核)。只需要简单的几步人机交互步骤,就可以适当的校准软件,使其准确的探测细胞和亚细胞结构。
描述:a. Definiens Tissue StudioTM 关于乳腺组织细胞及亚细胞结构探测的预览。在这一步骤中,用户可以交互式的对软件进行校准,直到得到想要的结果。
下一步要进行的设置工作是为生物标记物设定染色阈值。尽管软件可以给出默认的低、中、高阈值建议,这一步骤仍需要用户来定义最终阈值,以确保精确地针对生物标记表达对逐个细胞进行评估。
描述:b. Definiens Tissue StudioTM 染色强度预览(低、中、高)。如图a所示,用户可以自己调整软件直至得到想要的结果。之后该解决方案被保存,并应用于批量处理。
Definiens Tissue StudioTM 还可以通过分析排除细胞。在图9a和9b中,所有不含细胞核的细胞都被排除,不再参与下一步的分析。您还可以通过面积、长度、宽度、与边界之间的距离等因素排除细胞。
针对数字病理学图像研究,提供最全面的生物标记物与形态学量化分析
学术领域目前呈现出一种趋势,即:除对生物标记物表达进行定位之外,肿瘤形态在疾病的预断或治疗结果预测中也起到越来越重要的作用。Definiens Tissue StudioTM 为数字病理图像分析提供目前世界上最为全面的肿瘤形态量化分析。
显示图像对象表格与图像对象信息表格。点击任意对象(细胞、细胞核、细胞质、感兴趣区域等等),可以得到关于该对象的全部量化特征。
长度、面积、宽度、曲度、圆度、以及更多的基于强度、形状和背景环境信息的特征,都可以被测量出来。您还可以创建自己个性化的量化标准,且软件对于被测量或输出参数的数量没有任何限制。此外,对于全面的图像分析处理,软件也没有“速度限制”。无论是计算标记物强度、染色比例、阳性或阴性细胞核比例,抑或关于某个单独细胞的15个不同形态学特征,运转时间都是一样的。
全面支持组织芯片回顾性研究
组织芯片常被用于与肿瘤标记物和形态学分析有关的回顾性研究。在这些研究中,研究人员需要分析生物标记物表达之间的相互关系,肿瘤的形态,以及临床上最终所感兴趣的内容。Definiens Tissue StudioTM 3.0全面支持组织芯片分析(明视场或免疫荧光图像均可),并且支持以孔为标准的元数据输入。即使是严重不规则的组织芯片,Definiens Tissue StudioTM 3.0也可以轻易的与孔相匹配。
默认输出 感兴趣区域(ROI)属性 l 每个感兴趣区域类别的绝对与相对(百分比)区域面积 l 每个感兴趣区域类别的平均强度 l 感兴趣区域对象的个数 细胞核属性 l 组织学评分 l 阳性指数 l Allred评分(包括比例分数与强度分数) l 阴性与阳性(低、中、高染色强度)细胞核数目以及百分比 l 平均细胞核强度 l 荧光生物标记物共定位 l 荧光标记Pearsons and Manders相关系数 细胞属性 l 组织学评分 l ASCO/DAKO HER-2评分 l 阴性与阳性(低、中、高染色强度)细胞数目以及百分比 l 小、中、大细胞数目与百分比 l HER-2 0,1+,2+,3+细胞数目与百分比 l 细胞膜、细胞质或整个细胞中的平均强度 l 细胞膜、细胞质平均强度 l 平均细胞大小 l 荧光标记在不同区域的共定位和共表达 l 荧光标记Pearsons and Manders相关系数 血管属性 l 血管密度(包含或不包含内腔) l 小、中、大血管数目与百分比 l 阴性与阳性(低、中、高染色强度)血管数目以及百分比 l 血管尺寸的平均值与中值 l 血管壁厚度的平均值与中值 标记物区域属性 l 组织学评分 l 苏木精以及最多两种免疫组化标记物染色区域的绝对与相对(百分比)面积 l 低、中、高染色强度区域的绝对与相对(百分比)面积 l 平均染色强度 l 双重免疫组化染色或荧光标记的共定位 l 荧光标记Pearsons and Manders相关系数 |
自定义输出 l 面积 l 长/宽 l 圆度 l 椭圆率 l 形状指数 l 染色强度 l 染色变化 l 细胞器的染色比值 l 与其他细胞的相对边界 ……更多(请登录tissuestudio.definiens.com查阅) |
软件试用申请入口:
http://www.panspace.cc/minisite/shengming.asp
软件试用窗口:
http://www.definiens.com/downloads
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