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Definiens Tissue Studio 世界最先进的数字病理图像分析软件

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品牌:Definiens

产地:

型号:

市场价格:电询

北京全景天地科技有限公司
  • 联系人:郑立颖

    电话:010-62979127#8004

    邮箱:zhengly@panspace.com.cn

    地址:北京市海淀区上地三街9号嘉华大厦D座1101室

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详细信息
  •  Definiens Tissue Studio提供了无与伦比的组织形态与生物标志物表达定量分析解决方案,是生物标记物与形态学特征研究的最佳选择

      Definiens Tissue Studio提供局部单个细胞的生物标记物分析,同时也可对细胞和亚细胞结构进行相关的、多参数形态学定量分析。无论您使用的是明视场图像还是免疫荧光图像,是整体组织切片还是组织芯片,Definiens Tissue StudioTM 是您进行综合数字病理图像分析的最优手段。

       

    描述:图片1Definiens Tissue Studio全面支持免疫荧光图像的定量分析。在本案例中,被DAPI,CD206,CD68以及一种候选治疗抗体标记的异种移植组织中,细胞核被全部探测出来。最多可支持12个通道。

    Definiens Tissue Studio支持大多数的商业图像格式

    Definiens Tissue Studio支持市场上最常见的数字成像系统所生成的原始图像格式。这一特性使科研人员能够标准化图像分析平台,从而改善生产率和再生性。Definiens Tissue Studio同时也支持.tiff.jpeg.bmp以及.jpeg2000图像格式。

     

    一个简单的操作平台,同时适用于明视场与免疫荧光图像分析 

    只需简单的运行程序,选择你需要分析明视场或是免疫荧光图像,并选择切片或是组织芯片格式。无需任何附加软件。


    启动程序后,用户可从四种分析模式中进行选择:明视场(切片或TMA);免疫荧光(切片或TMA)。

    Definiens Tissue StudioTM 提供操作简便的四步工作流程

    载入、设置、运行、查阅,就是这么简单。初次使用的用户只需大约20分钟即可开发出个性化的图像分析解决方案。只需简单的“载入”图像数据,从一系列内置图像分析模块中选择并“设置”适当的解决方案,之后即可通过并行批处理的方式将其自动化“运行”于整个图像数据,并“查阅”分析结果。输出结果被保存在易于查找的文件夹中,并包含了所探测到结构的目视检查结果以及单一对象、分类后图像的统计学信息乃至更多。


    描述:Definiens Tissue StudioTM 4.0简单的四步工作流—载入、设置、运行、查阅。
     分析构建器(Analysis Builder)是Definiens Tissue StudioTM的核心。它是基于先进的图像分析技术基础上开发的一个简便而有效的用户界面;它可以使您针对不同类型的染色和组织类型,灵活的设置出稳健的解决方案。用户可以为需要探测的区域设置参数,同时也可以为区域内的亚细胞结构分析,以及不同的数据输出操作设置参数。


    描述:分析构建器简单的通过颜色来区分不同的设置面板,从而使开发个性化图像分析方案变得非常简单。

    使用Definiens ComposerTM技术探测感兴趣的区域交互、简单、精确、可靠

    Definiens ComposerTM技术是一种非常易于操作的方法,它可以被用来执行稳健的感兴趣区域的探测。在“实例学习(learn by example)”格式下,你只需要简单的使用画笔在相应的感兴趣区域涂上颜色,然后点击“学习(Learn)”按钮,系统就可以准确的识别所要探测的区域,整个过程操作简单。Definiens Tissue StudioTM 可以调整Definiens ComposerTM技术,从而应用于更为精确的感兴趣区域探测。


    Definiens ComposerTM技术控制面板。在Definiens Tissue StudioTM 中最新添加了“选择特征(select feature)”按钮,可以用来调整Definiens ComposerTM技术的性能表现。


    运行Definiens ComposerTM技术—在这幅图当中,所有被Her2染色的乳腺肿瘤组织被分类为橙色对象;周围组织为黄色;白色区域组织为蓝色。

    在需要手动注释时,Magnetic Snap工具可以帮助用户描绘感兴趣区域的轮廓,从而使手动注释更为快速和简单。Magnetic Snap工具可以与Definiens ComposerTM技术相结合使用。


    描述:使用Magnetic Snap工具

    Definiens Tissue StudioTM 可以精确的探测并分析细胞级组件

    在细胞级分析当中,Definiens Tissue StudioTM 可以实现对细胞核、细胞核形态、细胞(细胞质或细胞膜标记物)、标记区域以及血管组织进行分析 

    在通过Definiens ComposerTM技术对软件进行感兴趣区域识别训练后,还可以选择子集合(例如从肿瘤区域)来设置系统,以便正确的识别细胞和亚细胞物质(细胞膜、细胞质、细胞核)。只需要简单的几步人机交互步骤,就可以适当的校准软件,使其准确的探测细胞和亚细胞结构。


    描述:a. Definiens Tissue StudioTM 关于乳腺组织细胞及亚细胞结构探测的预览。在这一步骤中,用户可以交互式的对软件进行校准,直到得到想要的结果。

    下一步要进行的设置工作是为生物标记物设定染色阈值。尽管软件可以给出默认的低、中、高阈值建议,这一步骤仍需要用户来定义最终阈值,以确保精确地针对生物标记表达对逐个细胞进行评估。


    描述:b. Definiens Tissue StudioTM 染色强度预览(低、中、高)。如图a所示,用户可以自己调整软件直至得到想要的结果。之后该解决方案被保存,并应用于批量处理。

    Definiens Tissue StudioTM 还可以通过分析排除细胞。在图9a9b中,所有不含细胞核的细胞都被排除,不再参与下一步的分析。您还可以通过面积、长度、宽度、与边界之间的距离等因素排除细胞。 

    针对数字病理学图像研究,提供最全面的生物标记物与形态学量化分析

    学术领域目前呈现出一种趋势,即:除对生物标记物表达进行定位之外,肿瘤形态在疾病的预断或治疗结果预测中也起到越来越重要的作用。Definiens Tissue StudioTM 为数字病理图像分析提供目前世界上最为全面的肿瘤形态量化分析。


    显示图像对象表格与图像对象信息表格。点击任意对象(细胞、细胞核、细胞质、感兴趣区域等等),可以得到关于该对象的全部量化特征。

    长度、面积、宽度、曲度、圆度、以及更多的基于强度、形状和背景环境信息的特征,都可以被测量出来。您还可以创建自己个性化的量化标准,且软件对于被测量或输出参数的数量没有任何限制。此外,对于全面的图像分析处理,软件也没有“速度限制”。无论是计算标记物强度、染色比例、阳性或阴性细胞核比例,抑或关于某个单独细胞的15个不同形态学特征,运转时间都是一样的。


    典型的Definiens Tissue StudioTM 分析生成的范例数据。超过50个基于强度、形状和背景环境信息的特征可用。

    全面支持组织芯片回顾性研究

    组织芯片常被用于与肿瘤标记物和形态学分析有关的回顾性研究。在这些研究中,研究人员需要分析生物标记物表达之间的相互关系,肿瘤的形态,以及临床上最终所感兴趣的内容。Definiens Tissue StudioTM 3.0全面支持组织芯片分析(明视场或免疫荧光图像均可),并且支持以孔为标准的元数据输入。即使是严重不规则的组织芯片,Definiens Tissue StudioTM 3.0也可以轻易的与孔相匹配。


    上面几幅图针对一个非小型癌组织芯片进行了SOX2细胞核表达的分析。此研究得出结论:SOX2的高表达与鳞状非小型细胞肺癌患者的较长存活率相关。
    Tissue Studio分析功能

    默认输出

    感兴趣区域(ROI)属性

    l  每个感兴趣区域类别的绝对与相对(百分比)区域面积

    l  每个感兴趣区域类别的平均强度

    l  感兴趣区域对象的个数

    细胞核属性

    l  组织学评分

    l  阳性指数

    l  Allred评分(包括比例分数与强度分数)

    l  阴性与阳性(低、中、高染色强度)细胞核数目以及百分比

    l  小、中、大细胞核数目与百分比

    l  平均细胞核强度

    l  荧光生物标记物共定位

    l  荧光标记Pearsons and Manders相关系数

    细胞属性

    l  组织学评分

    l  ASCO/DAKO HER-2评分

    l  阴性与阳性(低、中、高染色强度)细胞数目以及百分比

    l  小、中、大细胞数目与百分比

    l  HER-2 01+2+3+细胞数目与百分比

    l  细胞膜、细胞质或整个细胞中的平均强度

    l  细胞膜、细胞质平均强度

    l  平均细胞大小

    l  荧光标记在不同区域的共定位和共表达

    l  荧光标记Pearsons and Manders相关系数

    血管属性

    l  血管密度(包含或不包含内腔)

    l  小、中、大血管数目与百分比

    l  阴性与阳性(低、中、高染色强度)血管数目以及百分比

    l  血管尺寸的平均值与中值

    l  血管壁厚度的平均值与中值

    标记物区域属性

    l  组织学评分

    l  苏木精以及最多两种免疫组化标记物染色区域的绝对与相对(百分比)面积

    l  低、中、高染色强度区域的绝对与相对(百分比)面积

    l  平均染色强度

    l  双重免疫组化染色或荧光标记的共定位

    l  荧光标记Pearsons and Manders相关系数

    自定义输出

    l  面积

    l  /

    l  圆度

    l  椭圆率

    l  形状指数

    l  染色强度

    l  染色变化

    l  细胞器的染色比值

    l  与其他细胞的相对边界

    ……更多(请登录tissuestudio.definiens.com查阅)

    软件试用申请入口:
    http://www.panspace.cc/minisite/shengming.asp
     
    软件试用窗口:
    http://www.definiens.com/downloads

    联系人:郑立颖
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